V druhom pokračovaní trilógie Matrix Neo (Keanu Reeves) spoločne s Morphom (Laurence Fishburne) a Trinity (Carrie-Anne Moss) bojujú proti počítačovým vládcom univerza. Chcú zastaviť zotročenie ľudstva a nemajú inú možnosť ako boj na život a na smrť. Sú nútení preniknúť hlboko do štruktúr Matrixu a v priebehu sedemdesiatich dvoch hodín objaviť a zlikvidovať centrum Zion i s jeho pomocnými jednotkami. A aby toho nebolo málo, Neo sa zo svojich temných nočných mor dozvie, že Trinitiným osudom je smrť. Neo sa však proti osudu už raz dokázal vzbúriť. Medzitým sa Trinity a Morpheus snažia zachrániť Kľúčiara, ktorý dokáže otvoriť každé dvere v Matrixe a je dôležitou zbraňou ľudí v boji proti strojom. I medzi robotmi prebieha súperenie o nadvládu nad virtuálnou realitou. Zároveň sa snažia objaviť posledné ľudské mesto Zion, ukryté v hlbinách Zeme. Všetky udalosti neodvratne smerujú k veľkej vojne ľudí proti strojom.

Predstavte si, že sa sťahujete z podnájmu do podnájmu a takto ste už za pár rokov vystriedali 49 domácností, ktoré ste museli zdieľať väčšinou s týpkami ako bankový úradník bývajúci v stane, albín opaľujúci sa pri mesačnom svite, psycho dráma kráľovná, požierači LSD a húb, mega huliči, flákači po bordeloch, ľudia štiaci do chladničky, hard core separatistické lesby a nakoniec kamoš, ktorý počas hlasnej muziky pri telke exituje s felafelom v ruke. No nedrblo by vás?!?

Austrálsky farmár Joshua Connor má zvláštny talent pre hľadanie vody pod zemou vo vyprahnutej krajine. Svoj inštinkt bude musieť využiť v životnom dobrodružstve, aby sa v cudzej nepriateľskej krajine dostal na miesto najstrašnejšej bitky prvej svetovej vojny a našiel svojich troch synov. Cesta ho z austrálskeho kontinentu vedie do Konštantínopolu (dnešného Istanbulu), na rozhraní Európy a Ázie, doprostred chaosu zmršťujúceho sa impéria Osmanskej ríše. Connor sa musí zorientovať v neznámom prostredí plnom exotiky. S nečakanou pomocou potom začína súkromné vojnové ťaženie, nemenej veľkolepé než to, ktoré tu nedávno skončilo.

Príbeh filmu je spojený s kontroverznými dokumentmi, ktoré odhalili a zverejnili novinári televízie CBS Mary Mapesová a Dan Rather. Tie sa týkali citlivých informácií o prezidentovi Bushovi, ktorý sa údajne vyhol vojne vo Vietname vďaka politickým konexiám svojho otca. Toto odhalenie v relácii 60 minút pred prezidentskými voľbami v USA v roku 2004 nakoniec stálo všetkých zúčastnených oveľa viac, ako pôvodne očakávali...