Seriál sa odohráva v dobe, kedy na svete existujú vedľa seba ľudia a mutanti. A keďže mutanti nie sú veľmi obľúbení, musia sa skrývať medzi ľuďmi tak, ako im to ich schopnosti dovolia. Ale aj medzi mutantami sa nájdu takí, ktorí sa nedokážu zmieriť s tým, že by sa mali práve oni skrývať pred niekým slabším. A preto vznikne skupina mutantov pod názvom X-men, ktorí sa snažia bojovať proti nepriateľským mutantom a takisto proti aktivistom, označujúcich sa za ochrancov ľudstva.

Mysteriózny sci-fi seriál je antológiou uzatvorených príbehov, ktoré na seba nenadväzujú, majú ale spoločný námet - rozprávajú o záhadných udalostiach a javoch, ktoré sa vymykajú bežnému chápaniu. Každý diel je oslavou ľudskej predstavivosti, ktorá s pomocou nových technológií presahuje úroveň súčasného poznania. Skeptický vedecko-technický pohľad na vec či človeka sa prejavuje zásadne v posledných sekundách konca epizódy, ktorý väčšinou postaví na hlavu celý predchádzajúci dej. ...Porucha nie je vo vašom prijímači... Neusilujte sa vyrovnať obraz... Vysielanie teraz riadime my... Nastavujeme obraz horizontálne i vertikálne... Môžeme vás zaplaviť tisíckou rôznych vysielacích kanálov.... Alebo rozvinúť len jeden obraz do krištáľového jasu.... A čo viac, môžeme vám vytvoriť víziu čohokoľvek, čo je schopná prijať vaša predstavivosť... Najbližšiu hodinu budeme riadiť všetko, čo uvidíte a vypočujete si.

V blízkej budúcnosti sa v kalifornskom Metro City rozmáha kriminalita a rôzne zločinecké gangy, najmä teroristická skupina Outfit, ktoré sú doslova roztrúsené po celom meste. Sú čoraz viac organizované a bránia sa dolapeniu políciou. Na boj proti páchaniu tejto extrémnej činnosti bola zriadená prísne tajná špeciálna jednotka, ktorú zriadila federálna vláda. Zbraňou, ktorá sa má na tento účel použiť, je špeciálne útočné vozidlo, ktoré sa pri transformácii maskuje ako auto Zmija.

Mike Ross má fotografickú pamäť a je veľmi inteligentný, no vďaka sérií 'nehôd' a 'nešťastných náhod' nikdy nedokončil vysokú školu. Vo chvíľach, ktoré trávi na úteku v dôsledku ďalšej nehody, ktorou je nevydarený drogový obchod, sa zhodou okolností pripletie na výberové konanie na post spolupracovníka Harveyho Spectora, jedného z najlepších právnikov na Manhattane. Mike je taký geniálny a očarujúci, že ho Harvey prijme za svojho asistenta aj napriek tomu, že nespĺňa základnú podmienku prijatia - nie je absolventom práva na Harvardovej univerzite. Ale takú maličkosť, akou je absolutórium Harvardu, predsa nebude preňho problém v práci hravo predstierať.

Súrodenci s výnimočnými schopnosťami sa znova stretnú po smrti svojho otca a odhalia šokujúce rodinné tajomstvá a nebezpečenstvo pre celé ľudstvo.

Seriál sa odohráva v dobe, kedy na svete existujú vedľa seba ľudia a mutanti. A keďže mutanti nie sú veľmi obľúbení, musia sa skrývať medzi ľuďmi tak, ako im to ich schopnosti dovolia. Ale aj medzi mutantami sa nájdu takí, ktorí sa nedokážu zmieriť s tým, že by sa mali práve oni skrývať pred niekým slabším. A preto vznikne skupina mutantov pod názvom X-men, ktorí sa snažia bojovať proti nepriateľským mutantom a takisto proti aktivistom, označujúcich sa za ochrancov ľudstva.