Krátko po japonskom útoku na Pearl Harbor počas druhej setovej vojny nastáva ďalší zlomový moment v Tichomorí. Námorníctvo USA opäť čelí početnejším a silnejším útočiacim japonským lietadlovým lodiam. Začína bitka o Midway, ktorá významne ovplyvní priebeh druhej svetovej vojny.

Píše sa rok 1988. Traja najlepší priatelia sa idú na výlet na heavy-metal show, kde sa spoja s tromi aspirujúcími hudobníkmi a vydávajú sa na afterpárty do jedného z dievčenských vidieckych domov. V noci sa zábavné a mladistvé hýrenie smrteľne otočí, ako sa telá začínajú hromadiť, pričom každá strana si myslí, že tá druhá skrýva vraha.

Kyberdoktor Ido prehľadáva skládky, aby našiel funkčné súčiastky, ktoré môže implantovať ľuďom, čo o časti tela prišli. Takto objaví Alitu, poničeného kyborga so srdcom a dušou dospievajúceho dievčaťa, a vráti jej život. Po prebudení Alita vôbec nič nevie. Nepamätá si svoju minulosť, nespoznáva svet okolo sebe, ale okamžite nasáva enormné množstvo nových informácií. So životom vrstovníkov Alitu zoznamuje Hugo, mladý rebel s motorkou, ktorý jej od prvého stretnutia mimoriadne imponuje. Vďaka svojej zvedavosti spozná Alita aj odvrátenú stránku mesta Iron City, v ktorom s doktorom Idem žije. Fyzickou konfrontáciou s podsvetím v sebe objaví mimoriadne, smrtiace schopnosti. V tú chvíľu sa dostane do hľadáčika skupiny nájomných zabijakov, ktorí terorizujú mesto, ale teraz dostali jedinú úlohu– nájsť a zničiť Alitu. Z obyčajného kyberdievčaťa sa stane bojový anjel. A konečne si spomenie, aké je jej poslanie.

Príbeh otroka menom Shields Green (Dayo Okeniyi), ktorý sa pri boji o vlastnú česť a slobodu svojho syna stane ikonou boja proti otroctvu.