Hrdinovia z prostredia "pod bodom mrazu" sa vracajú, aby zažili ďalšie neuveriteľné dobrodružstvá, tentoraz v ohromnom podzemnom svete dinosaurov. Je to farbistá krajina plná bujnej vegetácie, ktorá je ostrým protipólom mrazivého prostredia z prvých dvoch filmov. Je to krajina plná nebezpečenstiev, ohromných tvorov, rastlín pojedajúcich mamuty, zem plná tajomných miest. Večný smoliar, prehistorický veveričiak Scrat, má pred sebou osudové stretnutie s veveričkou Scratte. Mamuty Manny a Ellie očakávajú prvý prírastok do rodiny. Leňochod Sid sa zase dostane do problémov, keď si založí vlastnú rodinu s nájdenými dinosaurími vajíčkami. Šabľozubý tiger Diego rieši dilemu, či sa z neho v spoločnosti priateľov nestáva príliš veľký a mäkký dobrák. Navyše, keď sa objavia dinosaury, Manny prestáva byť "Lkráľom džungle". A napokon sa všetci zoznámia s jednookým lasičiakom Buckom, ktorý neúnavne loví dinosaury.

Pokračovanie snímky privedie diváka približne do doby pred 200 miliónmi rokov, kedy existoval jeden veľký kontinent, ktorému sa hovorilo Pangea. Tento superkontinet sa približne v tej dobe rozdelil na menšie kontinenty. A za to všetko môže chamtivá veverička, ktorá neustále zbiera svoje oriešky.

Vzácny papagáj Blu žije v malom meste so svojou paničkou Lindou, s ktorou tvorí nerozlučnú dvojicu. Nikdy sa nenaučil lietať, no vie uvariť kávu alebo spraviť raňajky. Keď jedného dňa Blu zistí, že ani zďaleka nie je posledným papagájom svojho druhu, neváha a spolu s Lindou sa vydá na cestu do exotickej Brazílie za papagájicou Perlou, ktorá žije v samotnom srdci mesta Rio de Janeiro. Krátko po tom, ako sa stretnú, ich unesie skupinka obchodníkov so zvieratami. Dokáže Blu s pomocou nových priateľov nájsť odvahu, aby sa naučil lietať, zmaril plány únoscom, ktorí sú im stále v pätách a vrátil sa späť ku svojej milovanej paničke Linde?

Horton je normálny slon v dobrej fyzickej i psychickej kondícii, a tak ho celkom prekvapí, keď mu pod nos spadne smietka prachu, ktorá hovorí. Celkom logicky sa domnieva, že chyba, teda vlastne hlasy, väzí v jeho hlave, a že sa proste a jednoducho zbláznil. Lenže Horton sa nezbláznil, a tá smietka naozaj hovorí. Je v ňom totiž ukryté malé mestečko Kdosice, v ktorom žijú malilinkí Ktoviečikovia. Medzi nimi aj Starosta - zaslúžilý obyvateľ, ktorý má niekoľko desiatok roztomilých dcér, spokojný život a pred sebou veľkolepú oslavou stého výročia svojho mestečka. A je tiež jediný, kto počuje Hortona. Aj Starosta si najskôr myslí, že mu v hlave preskočilo, ale našťastie mu včas dôjde, že neblázni a že Kdosice sú vo vážnom ohrození. Dostali sa totiž zo svojho starého a bezpečného úkrytu a ich osud teraz závisí na tom, či sa Hortonovi podarí Ktoviečikom pomôcť s hľadaním nového domova.